Les cystites sont généralement causées par des bactéries qui remontent les voies urinaires, certaines situations peuvent alors favoriser son développement :
> Une mauvaise hygiène dans les régions intimes chez la femme (souvent suite à contamination par les bactéries des selles).
> Des rapports sexuels chez la femme ("syndrome de la lune de miel").
Gabriel Schär, professeur de gynécologie et médecin-chef de la clinique pour femmes de l'hôpital cantonal d'Aarau (Suisse), explique pourquoi: «Le frottement occasionné par un rapport sexuel permet aux bactéries intestinales de passer plus facilement de la région anale à la région vaginale jusqu'à l'urètre et la vessie. Les germes s'arriment à la paroi de la vessie et provoquent ainsi une infection.»
> Des sondes urinaires
> Une grossesse (suite à une compression du foetus sur la vessie ce qui empêche une vidange complète)
Les femmes sont particulièrement concernées par la cystite, car elles ont un appareil urinaire qui favorise la contamination par des bactéries. >> voir aussi : statistiques
Les hommes sont moins concernés par ce problème, toutefois les hommes qui ont des problèmes de prostate sont plus touchés par les cystites.
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Les femmes sont particulièrement concernées par la cystite, car elles ont un appareil urinaire qui favorise la contamination par des bactéries. 
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